巴拉圭原為印地安人瓜拉尼族（Guarani）定居之地，1525年由葡萄牙人阿雷荷·加西亞（Alejo Garcia）發現，1537年西班牙殖民團體首建亚松森市。5年後天主教耶穌會傳教士也前往该地傳教並教授土人農牧及手工藝。1767年西班牙殖民者把耶稣会教士驱逐。18 世纪，巴拉圭地區是南美洲最大的人口集中地區。
1811 年5月15日時巴拉圭脫離西班牙独立，由罗德里格斯（Jose Gaspar Rodriguez de Francia）遂行獨裁統治。1840年法學教授洛佩斯（Carlos Antonio Lopez）繼任後，始採較開放之政策，從事農工商業各項建設。1844年巴拉圭再設議會，已初具獨立國家規模。
洛佩斯之子小洛佩斯（Francisco Solano Lopez）於1862年繼掌政權，醉心軍國主義。1865年至1870年間，巴拉圭發動了拉丁美洲史上最慘烈的戰爭——巴拉圭戰爭（Guerra de la Triple Alianza），在5年之間，巴拉圭因為與阿根廷、巴西和烏拉圭三國所合組的聯盟對抗作戰，折損了全國約2/3的成年男子人口與諸多领土，也造成該國在战后半世纪经济停滞。
1932 年至1935 年年的大厦谷战争中，巴拉圭战胜玻利维亚，從玻國取得大片格兰查科地區。翌年巴玻戰爭之統帥埃斯蒂加里维亚（Jose Felix Estigarribia）出任總統，旋於1940年8 月重頒憲法，分區治理，政治漸上軌道。
1947 年巴國發生為期六個月之內戰後由紅黨執政。1954年斯特罗斯纳將軍（Alfredo Stroessner，屬紅黨）發動政變，同年9月當選總統，嗣獲一再連任迄1989年2 月，始為罗德里格斯將軍（Gral. Andres Rodriguez）發動軍事政變推翻。从此開始實行民主制度选举总统。
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